Un organismo patógeno es una bacteria, hongo, prión o virus que sobrevive al alimentarse de un huésped. Un organismo patógeno generalmente causa una enfermedad en el organismo huésped.
Aunque la mayoría de las bacterias no causan enfermedades en los seres humanos, las personas con un sistema inmunitario suprimido son más susceptibles a los patógenos oportunistas que a menudo prosperan en el ambiente cálido y húmedo del cuerpo humano. Las respuestas naturales del cuerpo a los organismos patógenos invasores incluyen un aumento de la temperatura corporal. Muchas de estas respuestas naturales inhiben la capacidad de estos organismos para vivir y reproducirse. Para sobrevivir cuando se enfrentan a los antibióticos, algunas cepas de bacterias han evolucionado y desarrollado la capacidad de resistir las formas de medicación más comúnmente recetadas que se usan para eliminar al organismo de estos patógenos.