Muchas de las aves, reptiles, anfibios y mamíferos de la selva tropical están en peligro de extinción. Estos incluyen animales familiares, como los chimpancés de África Central, y animales relativamente desconocidos, como la rana elefante de Australia. Las selvas tropicales albergan más especies que cualquier otro hábitat terrestre.
Las aves de la selva tropical en peligro de extinción incluyen el jacinto y las guacamayas de Sudamérica y la cacatúa de cresta amarilla de Indonesia. La destrucción del hábitat es un problema grave para muchas de estas aves, pero algunas de ellas, en particular la guacamaya jacinto, también han experimentado una disminución de la población debido a la recolección para el comercio de mascotas.
Las poblaciones de anfibios en todo el mundo han estado disminuyendo durante varios años. Tanto la rana dardo venenosa dorada como la mantilla dorada son anfibios de la selva tropical en peligro de extinción. Las causas de la disminución de los anfibios no están claras en todos los casos y pueden deberse a la combinación de la destrucción del hábitat, los hongos, el cambio climático y la recolección.
Mamíferos como el rinoceronte de Java y el tigre de Sumatra están en peligro de extinción. Ambos son cazados por sus supuestas propiedades medicinales, pero también enfrentan hábitats cada vez más fragmentados. El perezoso de tres dedos y el perezoso de tres dedos son otros animales que están desapareciendo de sus hábitats de selva tropical.
