Si bien es posible aparear a un perro macho con su hija, es un proceso conocido como endogamia y puede crear problemas en la descendencia. Animales consanguíneos, que generalmente son consanguíneos para conservar los rasgos preferidos tienen una mayor incidencia de anomalías genéticas recesivas que se convierten en rasgos incapacitantes.
Algunas mutaciones negativas comunes de los perros consanguíneos incluyen la displasia de cadera y la luxación de la rótula. Los perros consanguíneos también sufren de sistemas inmunológicos más bajos y una fertilidad pobre, y tienden a ser menos inteligentes y, por lo tanto, menos entrenables que los perros no consanguíneos. Los perros consanguíneos también pueden ser más agresivos y mostrar más problemas de comportamiento que sus homólogos no consanguíneos.
