La clonación como tecnología se considera una mala idea en su nivel actual de desarrollo porque plantea una serie de preocupaciones éticas y biológicas. Estos incluyen la no viabilidad de muchos fetos clonados, el desarrollo de trastornos fisiológicos más adelante en la vida, la mayor susceptibilidad a las enfermedades transmisibles y otras circunstancias.
Los clones ocurren naturalmente en todas las áreas de la naturaleza. Cualquier gemelo idéntico, humano o no, es un clon. Muchas especies de microbios y algunas especies de animales y plantas se reproducen a través de la clonación. Los problemas surgen de los intentos humanos de crear clones artificiales, particularmente de mamíferos, ya que la tecnología aún está en su infancia y se desconocen muchos factores.
Más del 95 por ciento de los embriones clonados fertilizados no son viables y no pueden sobrevivir más allá de las etapas iniciales debido a defectos genéticos. Los clones que sobreviven a menudo desarrollan una serie de complicaciones más adelante en la vida, como órganos anormalmente agrandados, sistemas inmunitarios comprometidos y otros defectos genéticos. Estos factores son dilemas éticos preocupantes cuando se aplican a la posibilidad de clones humanos, ya que la clonación conduce a la posibilidad de muerte y sufrimiento humano.
Los expertos especulan que los clones producidos en gran número también pueden compartir la misma vulnerabilidad a las enfermedades transmisibles y podrían ser eliminados por un solo patógeno. Una población con genética más diversa resultaría más resistente. Las grandes poblaciones de clones también pueden sufrir eventualmente problemas de consanguinidad.