Cuando la electroforesis, también conocida como electroforesis en gel, se usa para separar las moléculas de ADN, una solución de las moléculas se coloca dentro de un gel. Las moléculas de ADN cargadas negativamente son arrastradas a través del gel por un campo eléctrico. Las moléculas de ADN que son pequeñas se mueven a través del gel más rápido que las moléculas grandes de ADN. El movimiento de las moléculas a través del gel crea una serie de bandas. Cada banda se separa en moléculas de ADN que tienen un tamaño particular. Las bandas que se encuentran más alejadas del inicio del gel contienen los fragmentos más pequeños de ADN, mientras que las más cercanas al inicio del gel contienen los fragmentos más grandes de ADN.
La electroforesis se utiliza para separar fragmentos de ADN para obtener una huella dactilar de ADN con fines forenses, pruebas de paternidad, verificar reacciones de PCR y buscar relaciones evolutivas entre organismos. El proceso también se utiliza para probar y localizar genes asociados con una enfermedad específica y para distinguir entre muestras de material genético.
