Los protozoos viven en mares, ríos, lagos, estanques, materias en descomposición y suelo. El agua es un requisito para su hábitat y pueden existir en diversas regiones donde está presente.
Los protozoos que viven en agua salada no requieren vacuolas, que son estructuras en el citoplasma que funcionan en la secreción intracelular. La concentración de sal dentro de la célula es similar a la concentración en el agua de mar y no hay necesidad de contraer y vaciar los fluidos. Los protozoos que poseen estas estructuras y viven en condiciones menos saladas vacían el agua a través de un poro en la membrana y el exceso de líquido entra en la célula.
