Un ejemplo de endogamia en la naturaleza es un grupo aislado de 40 sumadores en Suecia. Como no tenían acceso a otros de su especie, los descendientes de las serpientes se cruzaron repetidamente. La yegua campeona de carrera Coronation V es un ejemplo de endogamia como resultado de la selección artificial de un criador.
La endogamia se refiere al apareamiento de parientes cercanos. Ocurre en la naturaleza cuando las pequeñas poblaciones de una especie están aisladas de otras de su tipo, como cuando las actividades agrícolas aislaron a los agregados suecos. Otro ejemplo son los lobos grises de Isle Royale, Michigan, que no han podido cruzarse con lobos de Canadá debido a la falta de puentes de hielo entre estas poblaciones durante varios años. En ambos casos, la endogamia ha conducido a un mayor número de animales con deformidades y un menor éxito reproductivo. Debido a que los animales estrechamente relacionados son más propensos a compartir genes recesivos letales o perjudiciales, el apareamiento de estos animales aumenta el riesgo de que la descendencia hereda un gen recesivo perjudicial de ambos padres.
A pesar de los riesgos de la endogamia, los criadores humanos a veces se aparean con animales relacionados para producir un tipo consistente que exprese rasgos deseables. En el caso de la Coronación V, sus padres, un hijo e hija del campeón francés, el padre Tourbillon, fueron excelentes caballos de carrera. La Coronación V fue la mejor yegua de la carrera francesa de su tiempo, pero fue completamente estéril como una cría.