Un CD-R de 99 minutos, 4.7 pulgadas (12 cm) puede contener hasta 999.3 megabytes de datos. Los espacios en blanco de los CD-R de 99 minutos, sin embargo, no son tan populares como el disco estándar de 74 minutos y 670 MB debido a problemas de grabación y lectura asociados con el primero.
Aunque los diferentes CD-R se comercializan con una capacidad de almacenamiento de datos máxima establecida, por lo general se pueden escribir más datos, o "quemarlos" en el disco más allá de la capacidad establecida. Esto se debe a que la capacidad de almacenamiento de datos de los CD-R se mide a través de los datos de audio estándar del Libro Rojo que hacen una asignación de 90 segundos de silencio digital.
El área silenciosa o en blanco se denomina "salida" y esto se incluye en la mayoría de los CD-R junto con otras áreas estándar, como la entrada y el área del programa. Esta misma área en blanco se puede utilizar para escribir datos adicionales en el disco en una sesión de grabación de CD.
Por otro lado, el disco multisesión pierde espacio de almacenamiento de datos disponible con cada sesión de grabación de datos. En la primera sesión de grabación, se pierden aproximadamente 23 megabytes de datos. Las sesiones subsiguientes de grabación de datos provocarán la pérdida de 14 megabytes de espacio de almacenamiento en cada sesión.
Algunas unidades de CD-R también utilizan técnicas especiales para escribir más datos en el CD-R. Sin embargo, los datos escritos en el CD-R pueden no ser compatibles y legibles en otros reproductores de CD-R estándar.
