El nombre científico para el agua es agua u oxidano, según la Unión Internacional de Química Pura y Aplicada. El agua también puede denominarse H2O o HOH, según su composición de dos átomos de hidrógeno y un átomo de oxígeno.
Otros términos científicos para el agua incluyen óxido de hidrógeno, monóxido de hidrógeno, hidróxido de hidrógeno, óxido de dihidrógeno, ácido hidráulico, ácido hídrico y ácido hidroxicóxico. El término monóxido de dihidrógeno, abreviado como DHMO, también puede referirse técnicamente al agua, pero está más asociado a un engaño para referirse al agua como una sustancia tóxica. Cuando el agua está polarizada, puede denominarse hidróxido de hidrón. Los nombres de los compuestos relacionados incluyen óxido de deuterio, peróxido de hidrógeno y sulfuro de hidrógeno.