El clima de la zona intermareal depende del clima de la región circundante. Por ejemplo, el clima de la zona intermareal a lo largo de la costa de la Antártida es helado y volátil, mientras que el clima de La zona intermareal de una isla tropical es cálida y estable.
Debido a que el agua de la zona intermareal es tan poco profunda, está sujeta a cambios de acuerdo con las condiciones climáticas del aire de arriba. En regiones con patrones climáticos que cambian con frecuencia, las zonas intermareales pueden carecer de biodiversidad, ya que muchos organismos acuáticos no pueden adaptarse al clima inestable. Otra barrera para la biodiversidad es el alto contenido de sal en muchas zonas intermareales.
