El ciclo de vida de un hongo incluye una estructura fructífera que produce esporas, las esporas y la germinación de las esporas en un nuevo hongo. El mecanismo exacto difiere entre la reproducción sexual y asexual. >
La reproducción asexual en hongos ocurre de dos maneras. En el primero, el micelio, o cuerpo del hongo, produce esporas que se convierten en nuevos hongos. En el segundo, el micelio se fragmenta y cada pieza se convierte en un nuevo hongo. Ambos métodos de reproducción asexual dan como resultado nuevos organismos que son copias genéticas del original y permiten que las poblaciones se formen rápidamente.
La reproducción sexual en hongos implica la meiosis, al igual que en los animales. La reproducción sexual de los hongos comienza cuando se unen estructuras ramificadas, llamadas hifas, de dos organismos compatibles. Esta unión produce estructuras especializadas, o cuerpos fructíferos, que sufren meiosis, reduciendo a la mitad sus números de cromosomas. Las células haploides resultantes producen esporas que germinan para formar nuevos hongos. Al igual que en los animales, la reproducción sexual por hongos permite la variación genética dentro de las especies.
Las formas de reproducción tanto sexual como asexual a menudo requieren la dispersión de las esporas para evitar el hacinamiento en el área inmediata. Algunos hongos descargan sus propias esporas, mientras que otros dependen de las fuerzas ambientales, como los insectos, para hacerlo. La nube de polvo que emerge de un puffball es en realidad la dispersión de esporas de hongos.