La Guía de piedras preciosas coloreadas explica que el topacio se forma a través de procesos neumatolíticos en los que los gases calientes desempeñan un papel esencial. Se forma tarde en el enfriamiento de una masa ígnea rica en sílice.
Las acciones neumatolíticas producen topacio, casiterita, apatita y turmalina, los detalles de la Guía de piedras preciosas coloreadas. El topacio se encuentra típicamente como un componente de los diques de pegmatita donde los cristales alcanzan tamaños enormes. Además, ocurre en las cavidades de los gneises, esquistos y rocas altamente ácidas como la riolita. El topacio es un componente común en las gravas de gemas debido a su dureza y durabilidad relativa.
Según la Universidad de California en Berkeley, el topacio se cristaliza a partir de vapor rico en flúor en las etapas finales de la solidificación de rocas ígneas. A menudo se forma en cavidades en rocas graníticas y lavas, específicamente en pegmatitas y depósitos aluviales. Las concentraciones secundarias de topacio se encuentran en lechos de arroyos y otros depósitos aluviales.
El Departamento de Ciencias Geológicas de la Universidad de Texas afirma que, en las cavidades de gas de las rocas volcánicas, el topacio suele estar asociado con los depósitos de estaño. En las pegmatitas, generalmente se asocia con berilo, fluorita, turmalina y apatita. El topacio se crea generalmente como prismas bien formados con una buena resistencia. El topacio más natural es incoloro o tiene un color azul muy pálido. La irradiación, seguida del calentamiento, produce un topacio azul oscuro.