Los eruditos bíblicos no están de acuerdo sobre las circunstancias de la muerte de San Lucas. La mayoría de los eruditos católicos sostienen que murió a la edad de 84 años en Grecia, mientras que muchos eruditos ortodoxos afirman que fue martirizado después de la muerte de San Pablo.
En la tradición católica, a pesar de las afirmaciones de los primeros escritores cristianos de que San Lucas fue martirizado, los primeros documentos de que dispone la iglesia atestiguan que el apóstol se estableció en Grecia, escribió su evangelio y murió pacíficamente a los 84 años en Boeotia.
La historia de la Iglesia ortodoxa afirma que San Lucas predicó el evangelio después del martirio de San Pedro y San Pablo, atrayendo la atención de ciudadanos paganos y judíos. Según informes, estos individuos le dijeron al emperador romano Nerón que estaba practicando la hechicería. Nero respondió enviando a San Lucas, quien tuvo tiempo suficiente para entregar sus libros a un pescador local ante el público. Según los informes, Nerón le cortó la mano derecha, momento en el que San Lucas realizó un milagro volviéndolo a unir a este cuerpo y luego separándolo de nuevo. Si bien esto impresionó al gabinete del Emperador, quien luego profesó creer en Cristo, Nerón respondió decapitando a todo el grupo, incluido San Lucas, y mandando el cuerpo del santo al mar.