El Mar Rojo obtuvo su nombre de las bacterias rojas que habitan la parte superior del agua. También podría llamarse así por las personas que solían habitar sus orillas y por la dirección que es en relación con una antigua forma mediterránea de identificar direcciones.
No hay una razón definitiva para la forma en que este mar obtuvo su nombre misterioso, pero muchos creen que podría ser una combinación de todos los factores. El mar contiene un tipo especial de bacteria que se conoce como serrín marino. Esta bacteria se encuentra en la parte superior del mar y puede darle un tono ligeramente rojo si el momento y la iluminación son correctos. Los Himyaritas eran un grupo de personas antiguas que vivían a lo largo de las orillas del mar. Estas personas se asociaron con el color rojo y el mar podría haber sido nombrado debido a su prominencia en el área.
En la antigüedad del Mediterráneo, las direcciones se denominaban colores. Negro, rojo, verde y blanco fueron definitivos de Norte, Sur, Este y Oeste. El Mar Rojo estaba al sur y a menudo se lo conocía como el mar del sur o Mar Rojo en el lenguaje de las antiguas direcciones.