Las velocidades de difusión dependen de los tamaños moleculares porque las moléculas más grandes se difunden más lentamente que las moléculas más pequeñas. Los tamaños de las partículas involucradas en la difusión son importantes porque se relacionan estrechamente con los conceptos de calor y energía en el Contexto de difusión. Se necesita más energía y calor para mover un objeto más grande que uno más pequeño, por lo que las partículas más grandes requieren más calor de su entorno.
La difusión se basa en gran medida en la energía y el movimiento. En cualquier entorno dado, hay varios factores que afectan la movilidad de una molécula: el tamaño de la molécula, la viscosidad del entorno, las interacciones entre las macromoléculas y el tipo específico de transporte que utiliza la molécula. Debido a que la difusión se basa en el movimiento y el movimiento se basa en el tamaño de la molécula, existe una relación directa entre el tamaño molecular y la velocidad de difusión.
Las moléculas más grandes necesitan mayores cantidades de energía para participar en el mismo nivel de actividad que las moléculas más pequeñas. Si no hay suficiente energía para mover una molécula más grande, resiste los efectos de la difusión y no puede moverse de un área a otra. El aumento del calor ambiental u otros factores extraños también tienen un impacto en la energía involucrada en el proceso de difusión y en la velocidad a la que se difunde una molécula grande.