Los cerezos tienen un sistema de raíces muy poco profundas. Mientras que unos pocos árboles crecen sistemas de raíces muy profundos, la mayoría tiene raíces que solo crecen de 12 a 16 pulgadas de profundidad, y las raíces de los cerezos no crecen tan profundamente.
Las raíces de un cerezo tienen dos funciones principales. Las raíces más grandes anclan el árbol al suelo y transportan los nutrientes y el agua al resto del árbol. Las raíces alimentadoras más pequeñas extraen nutrientes y agua del suelo y luego las envían a las raíces más grandes. Dado que estas raíces más grandes son menos profundas y más verticales que muchos otros árboles, pueden causar daños en el concreto y el paisajismo. Es mejor plantar cerezos donde haya mucho espacio debido a sus raíces poco profundas.