Debido a su variedad de terrenos y ecosistemas, Perú alberga 500 especies de mamíferos, incluidos pumas, jaguares, osos de anteojos, monos lanudos de cola amarilla, llamas, alpacas y vicuñas. Para los mamíferos, el Perú tiene 1800 especies de aves y 300 especies de reptiles.
De las 500 especies de mamíferos en Perú, 70 son endémicas y casi 100 están amenazadas o en peligro de extinción. Entre las raras especies endémicas están el jaguar, el oso de anteojos y el mono lanudo de cola amarilla.
La selva tropical de Perú es parte de la selva tropical del Amazonas, que alberga muchas especies raras de aves, reptiles y mamíferos que no se encuentran en ningún otro lugar. En la costa del Pacífico de Perú, muchas especies se han adaptado a vivir en un clima de desierto seco. Las aguas costeras del Pacífico sustentan una vasta vida de peces y aves marinas, incluido el pingüino Humboldt. Perú también es conocido por sus montañas. Estas montañas apoyan el crecimiento de muchas hierbas y plantas que sirven como alimento para llamas, alpacas y vicuñas. Los mamíferos que viven en el Perú se han adaptado a vivir en grandes alturas.
En 2007, los científicos descubrieron una nueva especie de roedor de bosque nuboso en Perú. Está estrechamente relacionado con la rata espinosa. A partir de 2014, los científicos continúan descubriendo nuevas especies en los diversos ecosistemas de Perú.
