Los tigres javaneses se extinguieron principalmente porque sus hábitats naturales fueron destruidos y cultivados en beneficio de una población humana en rápido crecimiento, según About.com. Fueron cazados y envenenados, y se consideró que ser plagas por lo comunes que eran en Java a principios del siglo XIX. También hubo una mayor competencia por las presas cuando se introdujeron los perros salvajes en Java.
Después de la Segunda Guerra Mundial, muchos bosques naturales fueron destruidos para hacer plantaciones, que se utilizaron para teca, café y caucho. Esta fragmentación de los bosques hizo que los hábitats naturales dejaran de ser adecuados para sustentar la vida animal. La especie de presa más importante del tigre de Java, el venado rusa, estuvo plagada de enfermedades en muchos bosques y reservas durante la década de 1960, lo que contribuyó a la caída del tigre.
Aunque ha habido avistamientos no confirmados desde entonces, el último avistamiento documentado del tigre javanés fue en 1972, y la UICN declaró al tigre javanés oficialmente extinto en 2003. Hacia el final de la existencia del tigre javanés, estaban regulados en las afueras de Isla de Java, y la mayoría habitada en el Monte Betin, que es la parte más alta y remota de la isla.
Aunque era más grande que el tigre de Bali, el tigre de Java era una subespecie relativamente pequeña de los tigres del continente asiático.
