La mayoría de las teorías acerca de dónde el Mar Rojo obtuvo su colorido nombre se centró en una floración bacteriana roja que aparece periódicamente en su superficie, una asociación direccional o su asociación con los Himyaritas, gobernantes de Sheba. No histórico el registro especifica la razón exacta.
La respuesta más obvia de las tres posibles razones es la bacteria trichodesmium, a menudo llamada "aserrín marino", que flota cerca de la parte superior del agua y tiene un tono rojizo. Esta es la misma bacteria que se forma en el agua oceánica sin oxígeno, que a veces causa una "marea roja".
En el mundo antiguo, el rojo era uno de varios colores asociados con las direcciones. Negro estaba al norte, rojo estaba al sur, verde estaba al oeste y blanco estaba al este. Esta teoría supone que se consideró que el Mar Rojo se encuentra al sur del antiguo Cercano Oriente.
La última teoría es que el mar recibió el nombre de los Himyaritas, un pueblo que una vez vivió a lo largo de sus orillas cerca de Yemen y Etiopía. Los Himyaritas también se asociaron con la realeza de Sheba. "Himyer" se traduce libremente en "rojo", y Sheba está muy cerca del antiguo hebreo "seba" o rojo. Si bien no se sabe por qué se los llamó "gente roja", es posible que esto esté relacionado con el famoso tinte púrpura real obtenido del molusco murex, que se recolectó y procesó activamente en el área. La púrpura tiria, uno de este grupo de tintes, está más cerca del rojo y tiñe las manos de los tintoreros.