Joe Scarborough se divorció en enero de 2013, según TMZ. La pareja comenzó el proceso de divorcio en septiembre de 2012, y según los términos de un acuerdo, comparten la custodia conjunta de sus dos Niños menores de edad, a partir de octubre de 2015.
Joe Scarborough estableció los términos de su divorcio de su esposa Susan Waren al aceptar pagar los pagos de manutención de Susan de $ 30,000 por mes durante cinco años, seguidos de pagos de $ 25,000 por mes por otros dos años. La pareja continúa compartiendo la ocupación del hogar conyugal.
Scarborough niega los rumores de una relación romántica con Mika Brzezinski, su co-anfitrión en "Morning Joe" de MSNBC La ex esposa de Scarborough, Susan, trabajó anteriormente para el ex gobernador de Florida Jeb Bush. Antes de ser co-anfitrión de "Morning Joe", Scarborough era un miembro del Congreso de los Estados Unidos.
