Los cuerpos de agua principales de Pensilvania son el lago Erie, el río Delaware, el lago Conneaut, el lago Wallenpaupack, el río Susquehanna, el río Allegheny, el río Monongahela y el río Ohio. Los ríos Beaver, Clarion y Youghiogheny son importantes afluentes del sistema fluvial Allegheny-Monongahela-Ohio.
El estado de Pennsylvania tiene alrededor de 250 lagos naturales. La mayoría de estos se encuentran en las regiones noreste y noroeste. Pensilvania tiene jurisdicción de más de 21 millas cuadradas del Embalse Pymatuning, ubicado en la frontera del estado de Ohio. Casi el 46 por ciento del agua de las montañas de los Apalaches es drenada por el río Susquehanna y sus afluentes. La frontera este de Pennsylvania está formada por el río Delaware, mientras que su parte occidental está drenada por los ríos Allegheny y Monongahela.
