Los factores bióticos de los ríos incluyen insectos, peces, perifitones y macroinvertebrados bentónicos categorizados en grupos de alimentación funcional como trituradoras y herbívoras. Estos organismos vivos constituyen algunos de los factores bióticos más importantes en cualquier ecosistema fluvial Según la Educación de la Naturaleza.
El ecosistema fluvial proporciona un entorno dinámico para la diversidad biótica. Los ecólogos acuáticos tienden a centrarse en los macroinvertebrados bénticos en sus estudios sobre los ecosistemas fluviales debido a su abundancia y complejidad. Los cuatro grupos funcionales de alimentación de macroinvertebrados bentónicos incluyen trituradores, que cada uno deja; colectores, que consumen materia orgánica finamente particulada; los pastores, que se alimentan de perifón; y depredadores. El hábitat físico del propio río determina cuál de estas cuatro categorías de organismos es más pronunciada. Las corrientes templadas pequeñas, por ejemplo, proporcionan las condiciones ideales para que los trituradores y recolectores prosperen, mientras que los toldos que se abren en las corrientes más grandes brindan a los pastadores un mejor acceso a su fuente principal de alimentos, el perifito.
Los peces también son importantes contribuyentes al ecosistema del río, especialmente los peces anádromos que pasan la mayor parte de sus vidas en un ambiente marino y viajan río arriba para reproducirse. Estos peces aportan nutrientes marinos al medio ambiente, que al menos un experimento ha relacionado con una mayor abundancia de insectos en el ecosistema del río, como lo indica la Educación de la Naturaleza.
