Los cocodrilos se reproducen por copulación. La cópula generalmente ocurre en el agua, y si ocurre la fertilización, la cocodrilo hembra quedará embarazada y luego pondrá sus huevos.
La copulación del cocodrilo no ocurre hasta que se produce un cortejo algo complejo. El cocodrilo macho frota su cuerpo contra la hembra, y si ella es receptiva, hace vocalizaciones para que él sepa que debe proceder.
Un cocodrilo hembra pone entre 12 y 48 huevos en un nido después del apareamiento. Los cocodrilos del Nilo cavan un hoyo, luego depositan los huevos y lo rellenan con tierra. Los cocodrilos de agua salada construyen un montón de tierra y plantas para colocar sus huevos.
Los huevos eclosionan después de 2 a 3 meses, cuando los cocodrilos están completamente desarrollados.
