Según el Museo de Paleontología de la Universidad de California, los hongos tienen cuatro clasificaciones principales: quitridios, mohos de pan, levaduras y sacos y hongos de club. Cada clasificación difiere principalmente por el método de reproducción sexual, ya que todas las divisiones de hongos utilizan la reproducción de esporas de una manera ligeramente diferente.
Los nombres formales de estas clasificaciones son: chytridiomycota (chytrids), zygomycota (moldes de pan), ascomycota (levaduras) y basidiomycota (club hongos). Además, hay dos grupos polifiléticos que no son reconocidos por la comunidad científica. Estos son los deuteromycota (hongos asexuales que no se reproducen sexualmente) y los líquenes (comunidades simbióticas de hongos y algas). Juntos, estos grupos son todas las clasificaciones formales e informales para los hongos.
