Los usuarios pueden limpiar o reemplazar el filtro en una unidad de aire acondicionado de ventana. Algunas unidades tienen filtros reutilizables, que los usuarios lavan y vuelven a colocar en el aire acondicionado. Otros filtros no se pueden reutilizar y deben reemplazarse.
La limpieza o reemplazo de un filtro viejo y sucio puede reducir el uso de energía del acondicionador de aire en un 5 a 15 por ciento, según el Departamento de Energía de EE. UU. El propietario debe lavar o reemplazar el filtro de aire una vez al mes durante la temporada de enfriamiento para mantener el polvo fuera de los serpentines del evaporador. Es necesario realizar una limpieza más frecuente si la unidad se usa excesivamente, el área tiene polvo o la casa incluye mascotas.