Mientras que un horno autolimpiante puede ahorrar mucho tiempo y problemas en la cocina, los hornos extremadamente sucios requieren una limpieza previa de antemano. Ejecutar el ciclo de autolimpieza con una cantidad extrema de suciedad puede requerir múltiples ciclos y posiblemente dañar las superficies dentro del horno.
El ciclo de autolimpieza utiliza calor extremo para incinerar los residuos de alimentos. Algunos tipos de derrames se vuelven problemáticos a altas temperaturas. Los residuos azucarados pueden estallar en llamas y dañar el interior de la superficie del horno. Los aplastamientos pesados pueden bloquear el flujo de aire, causando el sobrecalentamiento de los elementos y posiblemente provocando una falla eléctrica. Cuanto más material haya que eliminar, más tiempo tendrá que trabajar el horno para quemarlo.
