Algunos tomates se vuelven negros en la parte inferior debido a la pudrición de la flor, que es el resultado de una deficiencia de calcio durante la formación. Esto es más común en la jardinería en macetas; sin embargo, puede ocurrir con cualquier tipo de jardinería.
La deficiencia de calcio se produce debido a un riego inconsistente, demasiada riego o fertilización demasiado o demasiado poco. Con muy poca agua, el suelo se vuelve muy seco y la planta no puede extraer suficiente calcio del suelo para el tomate. Demasiada agua esencialmente ahoga la planta y la hace incapaz de procesar los nutrientes del suelo. Los tomates alimentan mucho y necesitan una cantidad decente de fertilizante para seguir creciendo, pero un exceso de fertilizante puede matarlos. Al seguir las pautas adecuadas para el cultivo de tomates, se puede evitar la pudrición de la flor.