Los árboles de cornejo con flores son susceptibles a una gran cantidad de enfermedades, y algunas de ellas, como la antracnosis, afectan más las variedades de flores rosadas que las que tienen flores blancas. Aunque algunas de estas enfermedades solo causan Manchas menores o daños superficiales, otros son mucho más severos y pueden matar el árbol.
La antracnosis del cornejo, que ocurre comúnmente en el este de los Estados Unidos, es una de las enfermedades más dañinas para los árboles de cornejo rosado. La enfermedad, que es causada por una infección por hongos, comienza causando pequeñas manchas moradas o tostadas en las hojas del árbol. Si no se trata, pronto se puede propagar a las ramas y el tronco del árbol, causando grandes crecimientos o cancros. Estos cancros eventualmente pueden crecer alrededor de toda la rama o tronco, matando de hambre a los árboles de nutrientes y causando que mueran.
Crown Canker es la peor enfermedad que afecta a los árboles de cornejo en el este de los Estados Unidos, según el Jardín Botánico de Missouri. Esta enfermedad también es causada por una infección por hongos y puede conducir a la circunvalación del árbol. Sin embargo, esta enfermedad es más probable que mate al árbol que a la antracnosis del cornejo porque casi siempre ocurre en el tronco del árbol, mientras que la antracnosis a menudo se presenta en los tallos o ramas menores.
El moho gris, el mildiú polvoriento y la pudrición de la raíz de Armillaria son otras afecciones comunes en los árboles de cornejo que son causadas por diferentes tipos de hongos.