Los geckos tienen muchos depredadores naturales, el principal de ellos son las serpientes. Las arañas grandes, aves y otros mamíferos también comen geckos.
Cuando se enfrentan a un depredador potencial, muchos geckos pueden perder su cola. Esta autoamputación o autonomía ayuda al gecko a escapar porque la cola desprendida se retuerce y distrae al depredador, lo que permite que el gecko escape. En la mayoría de los casos, el gecko crecerá una cola de reemplazo hecha de cartílago. Una vez que el peligro haya desaparecido, un gecko a menudo regresará a su cola desprendida y, si está disponible, el gecko la comerá. Los geckos también pueden escapar de los depredadores usando sus almohadillas para los dedos de los pies que están diseñadas para escalar superficies verticales sin problemas.
