Hay algunas enfermedades que hacen que las plantas de albahaca se vuelvan marrones, como el mildiú velloso, el marchitamiento por fusarium y la mancha bacteriana de la hoja. Estas enfermedades causan manchas marrones y rayas en la planta, incluyendo Hojas y tallos.
Una de las enfermedades más graves para las plantas de albahaca es el mildiú velloso, causado por una enfermedad micótica. Las hojas se vuelven de color marrón o gris, comenzando con el amarilleo de la hoja superior de la planta. Luego, la parte inferior de las hojas se vuelve púrpura o gris porque ahí es donde se propagan las esporas de hongos. Finalmente, las hojas se vuelven marrones y mueren. Aquellos jardineros que lo atrapan temprano pueden remover las hojas enfermas, pero deben tener cuidado porque si las esporas se quitan, pueden propagarse.
Otra enfermedad que causa que una planta de albahaca comience a tornarse marrón es el marchitamiento por fusarium, que es un moho causado por una infección por hongos. Este moho usualmente infecta a las plantas porque está en el suelo. Hace que las hojas se marchiten, se vuelvan amarillas y se caigan, y los tallos se retuercen, se atrofien y se vean manchas marrones o rayas.
La tercera enfermedad que causa la albahaca marrón es la mancha bacteriana de la hoja, causada por la bacteria Pseudomonas cichorii. Esta enfermedad también se transmite en el suelo y vuelve las hojas y los tallos de color marrón.