John Hagee se divorció de su primera esposa, Martha Downing, en 1975. John y Martha se casaron en 1960, y la pareja tuvo dos hijos, Christopher y Tish.
John Hagee fue el fundador y pastor principal de Trinity Church. La noticia de su inminente divorcio sorprendió a su congregación. Martha obtuvo la custodia de sus dos hijos en el divorcio. En 1975, después de su divorcio, Hagee formó una nueva iglesia, La Iglesia de Piedra Angular. Después de fundar la nueva iglesia, Hagee se casó con Diana Castro y juntos tuvieron tres hijos: Christina, Mathew y Sandy. Hagee pasó a tener 13 nietos.
Algunos afirman que Hagee tuvo un romance extra matrimonial con Diana Castro, que había sido miembro de su congregación de la iglesia anterior. Hagee supuestamente escribió una carta a su iglesia admitiendo su inmoralidad.
