Algunas de las cadenas montañosas más importantes de Egipto son la región de alta montaña del Sinaí, el triángulo de Halayeb y la cordillera del desierto oriental. La región de alta montaña es parte de la península del Sinaí en el sur de Egipto, mientras que la región de Halayeb Triangle se encuentra en la costa africana del Mar Rojo y es una cadena montañosa que, a partir de 2014, se disputa entre Sudán y Egipto. La cordillera del desierto oriental se encuentra en el desierto del Sahara.
Gebel Katherina, o el Monte Catalina, se encuentra en la Región de Alta Montaña del Sinaí y es la montaña más alta del país con una altura de 8,625 pies. Junto a él está el famoso Monte Sinaí, que en realidad es una colección de cumbres. El extremo sur de la montaña, llamado Gebel Musa, tiene un amplio significado religioso y se considera un lugar bíblico.
La montaña más alta en el Triángulo Halayeb es Gebel Elba a 4,708 pies. Egipto, que la declaró como reserva natural, controla la región a partir de 2014, aunque Sudán también reclama el área. Ubicada a solo millas de distancia del Mar Rojo, la Montaña Elba recibe más precipitaciones que cualquier otra montaña costera en el área y tiene la mayor variedad de especies de plantas en todo Egipto. El Monte Shaiyb al-Banat es el pico más alto de Egipto continental fuera de la Región de Alta Montaña del Sinaí. La montaña en sí tiene un grupo de cuatro picos, con Gebel Shayeb El-Banat como el más alto en 7,175 pies.
