Los cuerpos de agua principales en Alemania son los ríos Danubio, Rin, Elba y Weser. Alemania tiene algunos lagos pequeños, pero estos son en su mayoría glaciares y están ubicados en las montañas. El lago más grande, Bodensee, se encuentra en la frontera de Alemania con Suiza y Austria.
Los ríos más grandes de Alemania son el Danubio y el Rin. El Rin tiene 820 millas de largo. Comienza en los Alpes suizos y corre hacia el norte hasta el Mar del Norte. Muchos ríos y afluentes más pequeños forman el sistema del Rin. Entre estos se encuentran los ríos Lippe, Ruhr, Mosel, Neckar y Main. El Rin es especialmente crítico para Alemania porque se puede navegar en barco en toda su longitud, por lo que es una importante ruta de envío para las mercancías.
El Danubio, que es uno de los ríos más grandes de Europa, está ubicado en el sur de Alemania. Comienza en la famosa Selva Negra de Alemania y fluye hacia el este hasta el Mar Negro. El sistema de Elba es el segundo río más largo de Alemania. Los ríos Oder y Neisse, aunque no son los ríos principales en Alemania, forman la frontera entre este y Polonia.
Aparte de los ríos y el lago ocasional, los manantiales minerales son una característica importante en Alemania. Estos manantiales cuentan con aguas frías y calientes, y son la base de varios balnearios famosos.
