Además de su característica más conocida, que es el canal artificial que lo divide, la República de Panamá contiene montañas escarpadas, llanuras costeras y colinas onduladas. La delgada franja de tierra que comprende la nación de 29,157 millas cuadradas que es un istmo que conecta los continentes de América del Norte y América del Sur. El Canal de Panamá, que se completó en 1914, permite a los barcos cruzar entre los océanos Atlántico y Pacífico que se encuentran al norte y al sur del Istmo de Panamá.
Panamá es el país más austral de América Central y limita con Colombia en el lado sudamericano y con Costa Rica en el lado centroamericano. La espina central del país de montañas y colinas interiores es la característica topográfica dominante de la nación. Los picos de esta columna vertebral se formaron por intrusiones volcánicas y la región montañosa fue el resultado de un levantamiento que se originó en el fondo marino. La cordillera central, que se extiende desde Costa Rica en el noroeste y hasta el canal, se conoce generalmente como la Cordillera Central. El punto más alto de Panamá es el pico de la montaña Volcan Baru a 11,401 pies.
Hay una jungla casi impenetrable, llamada Darien Gap, en el punto donde Panamá limita con Colombia. Esta área es la única ruptura en todo el sistema de carreteras panamericanas que conecta Alaska con la región de la Patagonia en el sur de Argentina.