La parte más profunda de la cuenca del Océano Atlántico es la Fosa de Puerto Rico, que se extiende al este desde la costa norte de Hispaniola hasta un punto más allá de las Antillas Menores. Esta zanja alcanza una profundidad máxima de 28,374 pies , que es aproximadamente 8,000 pies menos profunda que la Fosa de las Marianas del Pacífico.
La Fosa de Puerto Rico se formó a lo largo del límite entre la Placa del Caribe y la Placa de América del Norte. Muy poca subducción tiene lugar en la falla de transformación entre estas placas, y la mayor parte del movimiento es lateral. Esto reduce la actividad volcánica en el área, pero aumenta considerablemente el riesgo de terremotos.