Según el Servicio de Alguaciles de los EE. UU., uno de los primeros usos de las huellas dactilares para fines de identificación se remonta a la antigua Babilonia, hace aproximadamente 4,300 años, cuando los comerciantes usaban huellas dactilares en tabletas de arcilla para finalizar las transacciones comerciales. El primer uso de huellas dactilares con fines forenses en investigaciones policiales data de 1892, cuando Juan Vucetich, un oficial de la policía argentina, usó las huellas dactilares para identificar a un criminal por primera vez.
Las culturas antiguas en China, Persia, Grecia, Egipto y Roma utilizaron las huellas dactilares para establecer la identidad para muchos propósitos, incluso como marcas de fabricantes en cerámica, como decoraciones, para firmar contratos comerciales y para hacer préstamos entre individuos específicos. No utilizaron huellas dactilares para identificar a un individuo desconocido en la población general. Los registros legales muestran que durante la dinastía Qin, que duró de 221 a 206 a. C., los chinos reunieron huellas de manos, huellas y huellas dactilares como evidencia en una escena del crimen. Durante los siguientes siglos, los científicos y otros investigadores estudiaron las huellas dactilares con el fin de desarrollar una taxonomía de tipos y patrones. Los datos fueron útiles en muchas disciplinas y demostraron a los investigadores que las huellas dactilares eran únicas y podían usarse para establecer la identidad con certeza. Se atribuye a Sir Francis Galton las características de identificación de las huellas dactilares que aún utilizan los investigadores criminales a partir de 2014. El uso forense de las huellas dactilares se extendió rápidamente durante el siglo XX, y en 1971 el FBI tenía 200 millones de tarjetas de huellas dactilares en los archivos. Estos se convirtieron en la base de datos del Sistema automatizado de identificación de huellas dactilares.