La geografía del imperio inca era en gran parte montañosa y ocupaba gran parte de la costa oeste de América del Sur. Una gran parte del imperio inca existía dentro de una zona climática conocida como la tierra fría.
En su cima, el imperio inca ocupó casi 2,500 millas a lo largo de la costa oeste montañosa de América del Sur, extendiéndose desde el actual Quito, Ecuador al sur hasta Santiago, Chile. La principal característica geográfica de esta región es la Cordillera de los Andes, un área rica en diversidad geográfica. La región andina de América del Sur abarca un rango geográfico desde el desierto hasta el bosque lluvioso y el glaciar. Desde las montañas mismas, del oeste a la costa, es una región de desiertos. Los oasis hacen posible la vida en esta región árida, pero el imperio inca incluía uno de los desiertos más brutales de la Tierra, el Atacama, parte de la cual no ha experimentado lluvias en la historia humana registrada.
Las tierras bajas de los Andes albergan bosques tropicales húmedos y sabanas, mientras que las alturas más altas se convierten en bosques nubosos. Los bosques nubosos son frescos y húmedos, con una cubierta de nubes que prevalece durante casi 300 días del año. El clima aquí es compatible con la vegetación y la vida silvestre que no se encuentran en ningún otro lugar de la Tierra.
Una característica importante del imperio inca es el lago Titicaca, entre las naciones actuales de Perú y Bolivia. El lago Titicaca se encuentra dentro de una zona climática conocida como la tierra fría. La geografía y el clima únicos del lago proporcionan algunas de las mejores tierras agrícolas de la región.
