Neil Cavuto fue diagnosticado con linfoma de Hodgkin en estadio IV y esclerosis múltiple secundaria progresiva. Aunque sobrevivió a su cáncer en estadio IV, la EM no es curable. Afirmó en 2007 que a veces tiene dificultad para caminar y hablar.
Cavuto tenía linfoma de Hodgkin a fines de los años ochenta. Casi una década más tarde, en 1997, le diagnosticaron EM después de sufrir síntomas de ceguera, hormigueo y otras sensaciones extrañas. Cavuto continuó con su trabajo como presentador de noticias, aunque sufrió períodos de pérdida repentina de la visión al intentar leer el informador de noticias. Comenzó a memorizar sus guiones para evitar retrasos en la transmisión.
La fatiga, el dolor de cabeza, la atrofia muscular de las piernas, la pérdida de visión y la pérdida del habla están asociados con la EM. Como Cavuto tiene EM secundaria progresiva, es probable que empeore progresivamente con el tiempo. La medicación ayuda a permitir que Cavuto lleve una vida lo más normal posible.
Luego de ser diagnosticado, Cavuto comenzó como voluntario en la National MS Society. A partir de 2015, Cavuto aún trabaja para Fox Business Network y Fox News Channel. Trabaja como comentarista y presentador de televisión, y como presentador de tres programas de televisión. Reside en Nueva Jersey con su esposa y sus tres hijos.