De acuerdo con American Catholic, se atribuyeron numerosos milagros a San Francisco de Asís, la mayoría de ellos relacionados con su capacidad para comunicarse con animales e influir en la naturaleza. También hay historias sobre su capacidad para Curar personas y animales con un toque. Estos relatos de curación persistieron después de la muerte de Francisco cuando también se curaron peregrinos a los sitios que contenían sus reliquias santas.
Uno de los milagros más famosos atribuidos a San Francisco de Asís es la capacidad de predicar a las aves y otros animales salvajes. En una ocasión, se acercó a una gran bandada de pájaros que no volaban cuando se acercaba, sino que esperaban pacientemente por él. San Francisco de Asís predicó un sermón a los pájaros, que todos empezaron a cantar cuando terminó de hablar. En otra ocasión, Francis pacificó a un lobo que había estado matando ganado para que nunca volviera a molestar a la gente.
San Francisco de Asís también realizó milagros para la gente. Varios de sus milagros involucraron curar personas tanto de enfermedades físicas como mentales. También convenció a muchos criminales para que se arrepintieran de sus crímenes y se reconciliaran con la iglesia, incluida una instancia en la que convenció a tres ladrones que le habían robado para devolver lo que habían tomado y unirse a la orden franciscana.