La historia en el modo Zombie de "Call of Duty Black Ops 2" gira en torno a Edward Richtofen después de los eventos del DLC lunar de "Call of Duty Black Ops". El modo historia, titulado Tranzit, permite a los jugadores intentar resolver el misterio de por qué la Tierra se está muriendo mientras lucha contra interminables hordas de zombies. El jugador recibe ayuda de Richtofen y del Dr. Maxis.
Según el sitio web oficial de "Call of Duty", mientras que el modo Zombie de "Call of Duty" tiene un arco de la historia, no es una campaña debido a su característica infinita. Incluso el modo Tranzit en "Black Ops 2", mientras se enfoca en los aspectos de la historia, es principalmente un juego basado en la puntuación. "Black Ops 2" tiene cuatro modos diferentes de Zombie. Tranzit es una horda interminable de zombies con varios aspectos de la historia y un mundo abierto. El modo de supervivencia se lleva a cabo en un segmento específico del mundo abierto Tranzit y enfrenta a los jugadores contra una horda sin fin. El modo de dolor enfrenta a equipos de cuatro jugadores humanos entre sí, así como contra zombies. Los jugadores pueden elegir pelear entre sí o intentar usar zombies para su beneficio. Finalmente, los juegos personalizados permiten a los jugadores ajustar los tipos de elementos, las formas de matar zombies y el límite de tiempo de su juego.