Las principales formas de relieve en Mississippi incluyen la llanura de Mississippi; Planicie costera; humedales costeros; Mississippi, Pearl, Big Black y Yazoo; Embalse de Ross Barnett; Sonido de Mississippi; y los lagos Enid, Granada y Sardis. Otras formas de relieve importantes incluyen el río Pascagoula, el río Tombigbee, el lago Arkabutla, las montañas Cumberland, la bahía St. Louis, la bahía Biloxi, la bahía Pascagoula y el Delta del Misisipi.
La elevación más alta en Mississippi se encuentra en las estribaciones de las montañas Cumberland en Woodall Mountain, que mide 807 pies sobre el nivel del mar, mientras que la elevación más baja se encuentra a nivel del mar a lo largo de la costa del Golfo. La llanura costera del este del golfo cubre la mayor parte del estado, incluidas las colinas bajas de Pine Hills y North Central Hills. Sardis Lake es el lago más grande de Mississippi, con una superficie de 98,520 acres y un volumen de 1.51 millones de acres pies. Es alimentado por el río Little Tallahatchie. El Delta del Mississippi es el área delimitada por el río Mississippi y el río Yazoo y es parte de la llanura aluvial de Mississippi. El río más largo del estado es el río Perla, que ingresa al Golfo de México después de un recorrido de 450 millas. Mississippi Sound es el hogar de una serie de pequeñas islas que forman parte de la Costa Nacional de las Islas del Golfo, incluidas las islas de Petit Bois, Cat, Ship and Horn.