Las causas del agua marrón y turbia pueden incluir óxido en la tubería, otros problemas relacionados con el hierro, infiltración de la superficie y problemas de la estructura del pozo. Un diagnóstico adecuado requiere probar el agua en un laboratorio, lo que debe hacerse antes de llamar a un plomero.
El óxido suele ser la causa del problema cuando solo el agua caliente está descolorida. La oxidación también puede ser responsable si las tuberías de agua fría y caliente tienen agua de color marrón, pero esto suele ocurrir cuando solo hay un problema de plomería en la casa. Cuando el suministro de agua se cierra y se vuelve a encender, es común que el óxido en la tubería se desprenda y haga que el agua se vuelva marrón. Otras causas de la presencia de hierro en el agua incluyen la filtración de agua de la lluvia y la corrosión de la carcasa del acero.
Las inundaciones, la lluvia excesiva o el derretimiento de la nieve también pueden causar agua marrón y turbia debido a la infiltración de la superficie. Estos eventos causan problemas si la tapa del pozo no está bien sellada o está dañada. Las pruebas en el pozo para detectar coliformes y bacterias coliformes fecales pueden indicar una infiltración en la superficie porque el daño en la superficie del pozo puede permitir que estos tipos de bacterias ingresen en él.
Un problema con la estructura del pozo o el nivel del agua también puede ser responsable del agua marrón en el pozo. La bomba del pozo puede levantar lodo o podría estar golpeando el lado de un pozo, lo que ocurre cuando hay cambios en el suministro o nivel de agua.