El río Nilo y sus lagos adyacentes albergan más de 100 especies de peces, incluidas la perca, el pez gato y la tilapia. La tilapia y la perca son peces de alimentos populares con ciclos reproductivos rápidos. Los bagres del Nilo viven en el fondo del río y también son comestibles, pero son impopulares en muchas culturas porque comen peces muertos y moribundos y otro material que se hunde hasta el lecho del río.
La perca del Nilo son depredadores agresivos. Los ejemplares adultos son plateados con una delgada franja azul en ambos lados. A menudo miden más de 5 pies de largo y pesan más de 300 libras. Estos peces son muy populares entre los pescadores deportivos y son un componente importante de la industria del turismo en y alrededor de la cuenca del Nilo.
Los ciprínidos de plata también son abundantes en el ecosistema del Nilo. Estos peces con aletas radiadas viven en el Lago Victoria, una de las fuentes más grandes e importantes del Nilo. Los ciprínidos son nocturnos y se sienten atraídos por los señuelos luminiscentes, especialmente en noches nubladas o sin luna. Estos peces son una de las fuentes de proteínas más importantes para los seres humanos en Uganda, Tanzania y Kenia.
Muchos otros animales también viven en el Nilo y en sus orillas. Estos incluyen hipopótamos y rinocerontes. Los hipopótamos son especialmente temibles debido a su extrema agresión hacia los humanos, su extraordinaria velocidad de carrera y sus mandíbulas inmensamente poderosas.
