Algunas desventajas del manejo integrado de plagas, o MIP, es que su uso requiere un monitoreo regular, no se puede usar para todas las plagas, puede ser difícil determinar cuándo usar los aerosoles, no funciona con todos los entornos y los profesionales deben entender cómo funciona el MIP y seguir las prácticas de manera consistente. El propósito del MIP es reducir la frecuencia con que se deben usar los pesticidas, y algunos métodos utilizados incluyen control biológico, control químico, control cultural y selección de variedades.
IPM también tiene algunas ventajas. Primero, las personas que rocían químicos enfrentarán menos riesgos para la salud ya que los químicos no se rociarán tan a menudo. Segundo, no habrá tanta necesidad de uso químico en el futuro. Además, habrá menos resistencia a los pesticidas y contaminación.
