Un ratón de venado se puede identificar por su nariz larga y triangular y sus grandes ojos negros. El ratón de los ciervos suele ser de color marrón, mientras que un ratón doméstico común suele ser gris.
La parte superior del ratón del venado varía de marrón a rojizo, y el vientre del ratón es blanco. El ratón de venado tiene orejas grandes y redondeadas con pelaje escaso. Los ratones ciervos tienen colas largas que son rojizas o marrones en la parte superior y blancas en la parte inferior. Los ratones comunes tienen una cola sin pelo de color oscuro que es típicamente de color uniforme. Los ratones ciervos también pueden ser grises y blancos, en lugar de rojizos o marrones, dependiendo de la región donde vive el ratón. Tanto los ratones venados grises como los marrones tienen una parte inferior blanca y una cola bicolor.
Los ratones domésticos maduros son más grandes que los ratones ciervos. El tamaño típico de un ratón de venado maduro es de aproximadamente 4 pulgadas o 7 pulgadas, incluida la cola. Un ratón común alcanza hasta 8 pulgadas de largo.Las patas traseras de los ratones ciervos suelen ser más pequeñas que las de los ratones caseros comunes. Además, la separación de colores en ratones venados es notoriamente notable, mientras que un ratón común tiene colores que se mezclan gradualmente. Las diferencias de color entre los ratones ciervos y los ratones domésticos son particularmente distinguibles cuando se examinan las colas.