La principal diferencia entre AGP y PCI es que PCI, o las tarjetas de interconexión de componentes periféricos, solo tienen acceso a la memoria integrada en la tarjeta mientras que AGP, o las tarjetas de puerto de gráficos acelerados, tienen acceso a la memoria del sistema en orden para ayudar con operaciones complejas como el mapeo de texturas. Una ranura AGP le da a una tarjeta de video acceso directo al procesador a través de un bus dedicado, lo que le proporciona más ancho de banda que el PCI.
Las ranuras AGP también tienen un canal dedicado punto a punto que proporciona al controlador de gráficos acceso directo a la memoria principal del sistema cuando se procesan gráficos. Estas mejoras permiten que la tarjeta de video AGP funcione mucho más rápido que una tarjeta PCI.
Otra diferencia entre los dos es que PCI es un bus, mientras que AGP es un puerto, ya que conecta dos nodos. PCI y AGP también difieren en cuanto a la alineación mínima y los requisitos de longitud para las transacciones. Las transacciones PCI se alinean en los límites de 4 bytes y deben ser múltiplos de 4 bytes, mientras que las transacciones AGP se alinean en los límites de 8 bytes y deben ser múltiplos de 8 bytes. Las ranuras PCI y AGP son diferentes en tamaño. Esto significa que las tarjetas PCI no pueden caber en las ranuras AGP y viceversa. Cada uno de los sistemas gráficos tiene su propia conexión dedicada.