La mejor manera de limpiar las líneas de jarabe de una fuente de soda es lavar el sistema de tubos con una solución de limpieza sin receta sin cloro. El cloro corroe el plástico de los tubos y puede causar problemas de salud. Estas soluciones de limpieza están diseñadas como bolsas en una caja, que son similares a las cajas de suministro de jarabe utilizadas en las fuentes de soda.
Las bolsas de suministro de jarabe se conectan a los tubos del dispensario mediante un adaptador BIB. Este mismo adaptador se usa para conectar soluciones de limpieza en caja al sistema de tubos de la fuente de soda. Este proceso de limpieza funciona exactamente de la misma manera que cuando la máquina de soda está dispensando jarabe. La solución de limpieza está conectada a la fuente de soda donde normalmente se almacenan las bolsas de suministro de jarabe. Luego, debe presionar la palanca en la parte frontal del dispensador de soda, permitiendo que la solución de limpieza limpie el sistema. La solución de limpieza debe ejecutarse a través del sistema de tubos durante 15 a 20 minutos.
Time Magazine publicó una historia que destaca la necesidad de limpiar y enjuagar regularmente los sistemas de tubos de jarabe de fuente de soda. El artículo afirma que después de realizar un estudio de 30 sistemas diferentes de fuentes de soda en Virginia, se encontró que el 48 por ciento contenía bacterias coliformes, normalmente asociadas con heces humanas y animales.