Para completar el Pokédex en "Pokémon FireRed" es necesario recolectar todos los Pokémon normales del juego, todos los Pokémon legendarios y algunos otros Pokémon que solo se pueden adquirir intercambiando con otros jugadores. El sitio de estrategia Bulbapedia, muchos Pokémon solo se encuentran en la versión LeafGreen del juego y solo se puede obtener al intercambiar con un jugador que posee esa versión.
Según el sitio de estrategia Psypoke, hay diez Pokémon legendarios para ser recolectados en diferentes niveles del juego. Articuno se encuentra en el nivel inferior de las islas Seafoam. Zapdos se encuentra por la salida de la Central Eléctrica. Moltres se encuentra en la cima del monte. Ascua. Mewtwo se encuentra en el calabozo desconocido. Raikou, Entei y Suicune aparecen aleatoriamente en el mapa mundial después de que el jugador derrota a Elite Four, pero la apariencia de cada uno se basa en el Pokémon inicial elegido por el jugador. Lugia y Ho-Oh se pueden encontrar tomando el camino correcto y el camino izquierdo en la Isla 8, respectivamente. La versión defensiva de Deoxys aparece solo en la versión LeafGreen y debe intercambiarse con otro jugador. Muchos otros Pokémon aparecen en la versión LeafGreen y no en la versión FireRed, incluyendo Sandshrew, Vulpix, Bellsprout, Slowpoke, Staryu, Magby, Pinsir, Marill, Misdreavus, Sneasel, Remoraid, Octillery y Mantine. Un jugador que desee completar el Pokédex FireRed debe intercambiar para adquirir estos Pokémon.