No se necesitan herramientas para limpiar las licuadoras Ninja. El Mega Kitchen System, la licuadora Professional, la Nutri Ninja y la licuadora Ultimate requieren los mismos métodos de limpieza. La base del motor se limpia con un paño húmedo y las jarras, tapas, cuchillas y accesorios se pueden lavar en el lavavajillas.
Mientras se limpia la jarra en la rejilla inferior del lavavajillas, las piezas más pequeñas se colocan en la rejilla superior. Otra forma de limpiar una licuadora Ninja es llenándola tres cuartos con agua tibia, agregue una pequeña cantidad de líquido para lavar platos, ponga la tapa y presione PULSE varias veces. Una vez que la licuadora está limpia, todos los componentes se enjuagan con agua corriente. La licuadora no debe almacenarse hasta que las piezas se hayan secado completamente.