Peanut the Royal Blue Elephant, Coral Casino the Bear, Trap the Mouse y Slither the Snake son algunos de los más raros y coleccionables TY Beanie Babies. Otros bebés raros de Beanie son Peking the Panda, Senna-Kun the Dog, Softbank Hawks the Bear y Hong Kong Bear. De estos raros bebés Beanie de TY, los que alcanzan el precio de venta más alto incluyen la etiqueta original aún pegada.
Rex the Dinosaur, Steg the Dinosaur, Bronty the Dinosaur y Caw the Black Crow también son raros coleccionables de Beanie Babies. En cada una de las tres generaciones de Beanie Babies, hay varios animales raros que tienen precios altos cuando están en perfecto estado. Bumble the Bee, Dusty the Bear, Lucky the Ladybug, Manny the Manatee y Princess the Bear son otros Beanie Babies que son menos raros que algunos de los demás, pero aún tienen un precio considerablemente más alto que el precio de compra original.
Muchos de los raros Beanie Babies de colección se encuentran en conmemoración de un evento en particular y solo estaban disponibles para comprar en el evento, por lo que su lanzamiento es aún más limitado. Incluso los bebés Beanie más raros son animales de carrera corta que se suspendieron o cambiaron, lo que limita la cantidad producida y aumenta su costo.